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Colloque
La recherche scientifique est considérée comme une priorité par tous les gouvernements. Cette opinion est partagée par tous les partis politiques et le soutien à la recherche scientifique fait l’objet d’un remarquable consensus dans la population. Cependant, le principal argument pour expliquer les massifs investissements, en particulier publics, dans la recherche est que cela garantira une future et soutenue croissance économique. Il semble donc logique que les objecteurs de croissance s’intéressent à cette question. Dans cette présentation, j’argumenterai que la recherche scientifique, tout au moins sous sa forme actuelle, est non seulement incompatible avec une société durable mais aussi est …
Communication
Les scientifiques considèrent généralement qu’une meilleure connaissance du monde est une condition nécessaire à une meilleure protection de l’environnement et à une amélioration des conditions de vie. Par exemple, le GIEC fournit des efforts considérables pour mieux modéliser le climat et contribuer à la limitation du réchauffement. Cependant, l’histoire semble démontrer que ce n’est pas le cas : ainsi la biodiversité, bien mieux connue et modélisée qu’à l’époque de Linné, n’a jamais été autant érodée. Dans cette présentation, je me demanderai si la poursuite de cet idéal scientifique ne contribue pas significativement à la dégradation de l’environnement. Je détaillerai en …
Colloque
La phylogénomique, c’est-à-dire l’utilisation des données génomiques afin de reconstruire l’histoire de la vie sur Terre, est un domaine en pleine expansion. La principale raison est que l’utilisation d’un grand nombre de gènes apporte plus de signal phylogénétique. La phylogénie des Animaux illustrera que la résolution est effectivement améliorée, mais aussi qu’il existe des pièges. En effet, les erreurs systématiques deviennent plus apparentes avec beaucoup de données et la qualité du modèle d’évolution devient primordiale. Nous étudierons ensuite un aspect moins étudié de l’utilisation des données génomiques, celui de la datation moléculaire. Un alignement de 22082 positions pour 342 espèces …
Colloque
Depuis la fin du Moyen-âge, la mise au point de méthodes scientifiques et les améliorations techniques ont fait extraordinairement progresser la connaissance. Cet accroissement des connaissances, qui n’a pas de limites théoriques, est presque universellement considéré comme bénéfique, justifiant toujours une augmentation des budgets de la recherche scientifique. En particulier, cet accroissement est considéré comme nécessaire pour résoudre la crise environnementale. Je propose à l’inverse que cette approche cumulative sans fixation de limites est dangereuse. Premièrement, les ressources matérielles nécessaires à la recherche scientifique et les pollutions associées augmentent de manière exponentielle, ce qui semble difficilement évitable (toujours plus de …
Colloque
L'afflux de données de séquences nucléotidiques permet d'apporter un nouveau regard sur l'arbre généalogique du vivant. En retour, la phylogénie des organismes éclaire les données génomiques, en permettant de mieux connaître et comprendre les contraintes fonctionnelles agissant sur les diverses composantes de la cellule. Ces analyses posent bien sûr de nombreux problèmes bioinformatiques. Nous nous focaliserons d'abord sur les méthodes permettant d'inférer des arbres en utilisant de multiples gènes, en particulier pour contourner les difficultés dues aux transferts horizontaux de gènes et aux artefacts de reconstruction. Puis nous discuterons des méthodes in silico permettant de prédire les changements de fonction …
