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Colloque
Les familles de gènes répétés en tandem (GRT) représentent une fraction importante de la plupart des génomes. Elles participent à différents processus biologiques, comme la reconnaissance et la transduction de signaux (récepteurs olfactifs), la régulation de l'expression génique (ZNF, HOX) et le transport moléculaire (globines). Un mécanisme fondamental dans l'évolution de ces familles est la recombinaison inégale durant la méiose, qui peut entrainer la duplication (ou la délétion) simultanée d'un ou plusieurs gènes adjacents. De telles duplications sont dites « en tandem ». Différents algorithmes ont été proposés pour inférer l'histoire évolutive des familles de GRT. Leur usage est cependant …
Colloque
Un haplotype est une représentation condensée des caractères génétiques propre à un individu sur un segment chromosomique donné. Cette représentation prend la forme d'une séquence binaire où les 0 indiquent les allèles ancestraux et les 1 les allèles mutés. L'étude des haplotypes est fondamentale pour déterminer les allèles responsables de certaines maladies génétiques rares, et pour comprendre l'histoire des populations. La diversité des haplotypes à l'intérieur d'une espèce résulte de la redistribution des allèles mutés par recombinaisons et conversions géniques. Nous allons présenter une méthode permettant de reconstruire un haplotype donné, par recombinaisons et conversions géniques, à partir de ses …
