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Dynamique de molécules rigides dans un nanoréseau de constrictions
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L'avènement de la photolithographie a ouvert la voie à la construction de nano-réseaux de constrictions, dans le but de remplacer l'électrophorèse sur gel, en offrant la possibilité de construire un système selon les dimensions nécessaires au problème rencontré. Pour notre projet, nous effectuons des simulations numériques de dynamique moléculaire de type Langevin, en suivant le modèle de Kremer et Grest. Nous vérifions d'abord la validité de notre système en reproduisant des résultats connus. Ensuite, nous testons l'hypothèse avancée par Laachi (Laachi et al., PRL, 2007), qui explique que la mobilité plus élevée des molécules plus longues est causée par l'action …

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Dynamique de molécules rigides dans un nanoréseau de constrictions
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L'avènement de la photolithographie a ouvert la voie à la construction de nano-réseaux de constrictions, dans le but de remplacer l'électrophorèse sur gel, en offrant la possibilité de construire un système selon les dimensions nécessaires au problème rencontré. Pour notre projet, nous effectuons des simulations numériques de dynamique moléculaire de type Langevin, en suivant le modèle de Kremer et Grest. Nous vérifions d'abord la validité de notre système en reproduisant des résultats connus. Ensuite, nous testons l'hypothèse avancée par Laachi (Laachi et al., PRL, 2007), qui explique que la mobilité plus élevée des molécules plus longues est causée par l'action …

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Comment libérer les particules prises dans un gel : une étude numérique
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Les champs pulsés sont de plus en plus utilisés en électrophorèse sur gel pour augmenter la résolution. En 1993, Boyde et To ont publié des résultats expérimentaux sur la séparation de sphères en utilisant des champs pulsés. Ils présentent deux régimes : un champ alternatif ayant une valeur de champ constante en valeur absolue, et ensuite en interrompant le champ pour permettre aux particules de sortir des pièges sous l'effet du mouvement brownien. Nous modelisons le gel d'électrophorèse comme un système 2D d'obstacles sur un réseau. Nous utilisons une méthode nous permettant de calculer la vitesse moyenne exacte pour premièrement …

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