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Colloque
Le repliement de la chromatine à l'intérieur du noyau de la cellule joue un rôle clé dans la régulation de l'expression des gènes. Dans cette présentation, je parlerai d'un projet mené en collaboration avec Dr. Josée Dostie (McGill) sur la détermination de la structure du cluster Hox B humain lors de la différenciation de cellules THP-1 par l'utilisation de la technique 5C (Capture de conformation de chromatine par copie carbone). Nous présenterons la méthode expérimentale et les techniques bioinformatiques requises pour l'analyse robuste de ce nouveau type de données génomiques. Finalement, nous démontrerons comment l'expression des gènes du cluster est …
Colloque
Le repliement de la chromatine à l'intérieur du noyau de la cellule joue un rôle clé dans la régulation de l'expression des gènes. Dans cette présentation, je parlerai d'un projet mené en collaboration avec Dr. Josée Dostie (McGill) sur la détermination de la structure du cluster Hox B humain lors de la différenciation de cellules THP-1 par l'utilisation de la technique 5C (Capture de conformation de chromatine par copie carbone). Nous présenterons la méthode expérimentale et les techniques bioinformatiques requises pour l'analyse robuste de ce nouveau type de données génomiques. Finalement, nous démontrerons comment l'expression des gènes du cluster est …
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Le repliement de la chromatine à l'intérieur du noyau de la cellule joue un rôle clé dans la régulation de l'expression des gènes. Dans cette présentation, je parlerai d'un projet mené en collaboration avec Dr. Josée Dostie (McGill) sur la détermination de la structure du cluster Hox B humain lors de la différenciation de cellules THP-1 par l'utilisation de la technique 5C (Capture de conformation de chromatine par copie carbone). Nous présenterons la méthode expérimentale et les techniques bioinformatiques requises pour l'analyse robuste de ce nouveau type de données génomiques. Finalement, nous démontrerons comment l'expression des gènes du cluster est …
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Le repliement de la chromatine à l'intérieur du noyau de la cellule joue un rôle clé dans la régulation de l'expression des gènes. Dans cette présentation, je parlerai d'un projet mené en collaboration avec Dr. Josée Dostie (McGill) sur la détermination de la structure du cluster Hox B humain lors de la différenciation de cellules THP-1 par l'utilisation de la technique 5C (Capture de conformation de chromatine par copie carbone). Nous présenterons la méthode expérimentale et les techniques bioinformatiques requises pour l'analyse robuste de ce nouveau type de données génomiques. Finalement, nous démontrerons comment l'expression des gènes du cluster est …
Colloque
Dans les génomes de vertébrés, l'expression des gènes n'est pas seulement régulée par leur promoteur mais aussi par des régions régulatrices situées à de bien plus grandes distances d'eux (e.g. plusieurs centaines de milliers de paires de bases). Ce type de régulation est appelé régulation à "longue-distance". Dans cette présentation, nous étudierons les effets de ce type de régulation sur l'évolution des génomes de vertébrés, se concentrant sur les réarrangements. Par la suite, nous démontrerons comment l'étude des réarrangements des génomes permet de faire des prédictions quant au(x) gène(s) régulé(s) par chaque région régulatrice, un problème pour lequel les méthodes …
