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Colloque
Chez plusieurs bactéries et archaea, la synthèse de l’asparaginyl-ARNtAsn et/ou du glutaminyl-ARNtGln est catalysée par l’action consécutive de deux enzymes. Dans la première réaction, catalysée par des aminoacyl-ARNt synthétases non-discriminantes (aaRS-ND), l’acide aspartique (Asp) est estérifié sur l’ARNtAsn , et l’acide glutamique (Glu) est estérifié sur l’ARNtGln. Dans la seconde réaction, une aa-ARNt amidotransférase transforme ces deux aa-ARNt incorrects en Asn-ARNtAsn et en Gln-ARNtGln, respectivement (1). Chez plusieurs microorganismes thermophiles, les enzymes qui catalysent ces circuits indirects d’aminoacylation forment des complexes stables, nommés « transamidosomes » (2). L’existence de tels complexes chez des bactéries mésophiles a été suggéré par l’influence …
Communication
L'utilisation abondante des antibiotiques a mené à l'apparition de résistances chez les pathogènes. Le développement de nouveaux agents thérapeutiques est, par conséquent, une priorité. Les aminoacyl-ARNt synthétases (aaRS) catalysent l'estérification d'un acide ribonucléique de transfert (ARNt) avec l'acide aminé correspondant; elles sont impliquées dans la biosynthèse des protéines. L'inhibition sélective de l'enzyme bactérienne est possible grâce à une évolution divergente de l'enzyme humaine. Ces enzymes sont donc des cibles potentielles pour le développement d'agents thérapeutiques. Le design des inhibiteurs d'aaRS bactériennes est basé sur l'intermédiaire de la réaction catalysée par les aaRS, soit l'adénylate d'aminoacyle. La synthèse de dérivés aminoalcools …
Communication
Les aminoacyl-tARN sunthétases sont des enzymes essentiels du système de traduction transformant l'information contenue dans les acides nucléiques en séquences d'acides aminés dans les protéines. Ces enzymes fixent les acides aminés sur les acides ribonucléiques de transfert correspondants avec une fidélité remarquable. Plusieurs inhibiteurs de la glutamyl et de la glutaminyl-tARN synthetase ont été préparés. Un des inhibiteurs a été co-cristallisé avec la glutamyl-tARN synthetase de T. thermophilus, ce qui a permis la détermination de la structure 3D de cet enzyme à l'aide d'un synchrotron. Étant donnée la divergence évolutive des enzymes bactériens et humains, ces inhibiteurs pourraient servir de …
Colloque
Les aminoacyl-ARNt synthétases (aaRS) sont des enzymes impliquées dans la biosynthèse des protéines. Plus particulièrement, elles permettent l'estérification d'un acide aminé sur l'ARNt correspondant. La glutamyl-ARNt synthétase (gluRS) et la glutaminyl-ARNt synthétase (glnRS) permettent respectivement l'estérification de l'acide glutamique et de la glutamine sur l'ARNtglu et sur l'ARNtgln. Le design des inhibiteurs est basé sur l'intermédiaire de la réaction catalysé par les aaRS soit l'adénylate d'aminoacyle. Ainsi, le glutamol adénylate a inhibé la gluRS de E. coli (Ki = 3 µM) et le glutaminol adénylate la glnRS de E. coli (Ki = 280 nM). Le glutamol adénylate a également été …
Colloque
La glutamyl-ARNt synthétase (GluRS) est responsables de la biosynthèse du Glu-ARNtGlu. Cette réaction est réalisée en deux étapes : 1) activation du glutamate (en présence d’une molécule d’ATP) et 2) son transfert sur le ribose de l’adénosine 3’ terminale de l’ARNt. Chez les GluRS, cependant, la présence de l’ARNt est requise à la première étape. La traduction fidèle des codons associés au glutamate lors de la biosynthèse des protéines dépend ainsi de la capacité de la GluRS à reconnaître spécifiquement ses substrats (ARNtGlu, glutamate et ATP). La GluRS est une enzyme modulaire composée de 5 domaines. Le rôle d’un atome …
Colloque
L’analyse du génome de Pseudomonas aeruginosa nous a permis d’identifier les gènes qui codent pour la GluRS, la GlnRS, l’AspRS et une amidotransférase (AdT). Par ailleurs, le gène encodant l’AsnRS n’a pas été identifié. Ces observations nous ont amenés à tester la présence chez P. aeruginosa des sentiers de synthèse du Gln-ARNtGln et du Asn-ARNtAsn. Les mesures des activités acceptrices de l’ARNt total de P. aeruginosa pour le glutamate et la glutamine ainsi que la toxicité à surproduire la GluRS chez E. coli indiquent que la GluRS est non discriminatoire (capables de glutamyler l’ARNtGlu et l’ARNtGln); cette hypothèse a été …
Communication
Les aminoacyl-tARN synthétases sont des enzymes essentiels du système de traduction transformant l'information contenue dans les acides nucléiques en séquences d'acides aminés dans les protéines. Ces enzymes fixent les acides aminés sur les acides ribonucléiques de transfert correspondants avec une fidélité remarquable. Une connaissance du mécanisme de réaction a permis le design de bons inhibiteurs des glutamyl-tARN et glutaminyl-tARN synthétases. Dans certains cas, ces inhibiteurs pourraient servir de composés modèles dans la mise au point d'antibiotiques.
Communication
Les 20 aminoacyl-ARNt synthétases, qui catalysent la première étape de la biosynthèse des protéines sont regroupées en deux classes structurales distinctes comprenant chacunes 10 membres. L’alignement des séquences peptidiques de quelques glutamyl-ARNt synthétases (GluRS) et glutaminyl-ARNt synthétases (GlnRS), qui appartiennent à la classe 1, avait permis d’identifier 6 régions (a-g) particulièrement bien conservées et appelées motifs (1). Jusqu’à maintenant, aucune fonction n’a pu être attribuée au motif g (G254YLPEAL chez la GluRS de E. coli), situé à bonne distance du site actif. La substitution de la glycine254 par un aspartate rend la GluRS de E. coli thermosensible. La publication récente …
Colloque
Les aminoacyl-ARNt synthétases catalysent une des étapes clef de la biosynthèse des protéines, soit l'aminoacylation des ARNts avec leurs acides aminés respectifs. Le gène gltX de B. subtilis, qui code pour la glutamyl-ARNt synthétase, est suivi des gènes cysE et cysS, qui codent respectivement pour la sérine acétyl-transférase et la cystéinyl-ARNt synthétase. Ces trois gènes sont transcrits à partir du promoteur constitutif de gltX. Une région pouvant adopter des structures secondaires alternatives de type terminateur-antiterminateur, ainsi qu'une région conservée chez la plupart des transcrits des gènes des aminoacyl-ARNt synthétases et certains gènes de biosynthèse d'acides aminés de B. subtilis, se …
Colloque
Les aminoacyl-ARNt synthétases (aaRS) sont des enzymes ubiquitaires chargeant de manière spécifique les ARNs de transfert avec l'acide aminé qui leur est propre, réalisant ainsi une étape préliminaire essentielle de la biosynthèse des protéines. À ce jour, la plupart des gènes codant pour les aaRS de la bactérie Bacillus subtilis ont été clonés, séquencés et situés sur le chromosome. Les gènes gltX et cysS de cet organisme, codant respectivement pour la glutamyl-ARNt synthétase (GluRS) et la cystéinyl-ARNt synthétase (CysRS) sont exprimés à partir d'un même opéron qui contient aussi, en aval de gltX et en amont de cysS le gène …
