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L'électrophorèse sur gel de polyacrylamide en présence de dodécyl-sulfate de sodium (SDS) a été utilisée pour comparer des souches de Frankia issues de plantes hôtes du genre Alnus, Elaeagnus, Comptonia et Myrica de provenances géographiques diverses. Nous avons observé une grande diversité de patrons protéiques de lysats de cellules entières au sein du genre Frankia. D'autre part, en plus d'un critère morphologique, nous avons utilisé les patrons de protéines pour identifier des souches de Frankia résolues à partir de nodules et de plants d'aulne inoculés avec une ou plusieurs souches.