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Très peu de génomes chloroplastiques d'algues vertes ont été étudiés jusqu'à ce jour. Contrairement à ceux des plantes terrestres qui ont été largement caractérisés et qui se sont révélés extrêmement conservés tant au niveau de leur taille et de leur structure que de l'ordre de leurs gènes, les quelques génomes chloroplastiques d'algues vertes qui ont été cartographiés présentent une très grande diversité à tous ces niveaux. Dans le but d'élargir nos connaissances sur l'évolution du génome chloroplastique chez les algues vertes, nous avons entrepris la construction de la carte physique et génétique de l'ADNcp chloroplastique (ADNcp) de Tetraselmis carteriiformis, une …
Nous avons récemment mis en évidence un total de 39 introns du groupe I dans le gène codant pour la grande sous-unité de l'ARN ribosomique chloroplastique de 17 algues vertes unicellulaires appartenant au genre Chlamydomonas. Ces introns représentent 12 positions d'insertion distinctes et sont distribués de manière très irrégulière. Dans l'étude que nous présentons ici, nous avons déterminé si la composition en intron du gène codant pour la petite sous-unité de l'ARN ribosomique chloroplastique (SSU) est aussi variable. Dans le but d'identifier et de localiser les introns, nous avons amplifié, par réactions PCR, les gènes SSU de 14 espèces de …
Comme c'est le cas pour tous les marqueurs génétiques chloroplastiques dans les croisements intraspécifiques chez Chlamydomonas reinhardtii, la plupart des marqueurs polymorphiques entre les ADN chloroplastiques de C. eugametos et C. moewusii sont préférentiellement transmis par le parent mt+ dans les croisements interspécifiques entre ces algues. Cependant, trois marqueurs polymorphiques, représentant des séquences optionnelles, sont transmis à la totalité de la progéniture, même s'ils proviennent du parent mt-. Il s'agit du cinquième intron dans le gène codant pour la grande sous-unité de l'ARN chloroplastique de C. eugametos, et des séquences de 6 et 21 kilopaires de bases (kpb) de C. …
C. moewusii possède un ADN linéaire de 6 kb dont la séquence existe aussi sous forme intégrée dans le génome chloroplastique de cette algue. Bien que sa fonction demeure inconnue, la séquence de 6 kb ne semble pas essentielle à la survie de la cellule puisqu'elle s'épanouit différemment et augmente son état déployé. Dans le but de déterminer comment cette séquence est maintenue sous forme libre dans la cellule, nous avons étudié la séquence de la région de 6 kb intégrée dans le plasmopool hybride et sa conversion entre c. augmentes et c. moewusii. Nous avons observé que, dans tous …
Les introns du groupe I sont capables de s'autoépisser en l'absence de protéines et forment une famille montrant une distribution étendue, mais irrégulière chez des organismes phylogénétiquement très divergents. Une telle distribution peut s'expliquer par la capacité de ces introns à s'insérer et s'exciser des gènes cibles. La base moléculaire d'un phénomène de mobilité d'intron de groupe I, appelé "intron homing", a été récemment rapporté dans la littérature. Nous tentons maintenant de mettre en évidence la transposition d'introns d'un gène cible à un autre, un type de mobilité qui n'a pas encore été confirmé expérimentalement. Pour atteindre cet objectif, nous …
Notre récente comparaison des génomes chloroplastiques des algues interfécondes C. eugametos et C. moewusii a révélé une différence de délétion/addition de 21 kilopaires de bases (kpb) dans le voisinage du gène codant pour la protéine de 32 kilodaltons du photosystème II (psbA) (Lemieux et al. (1985) Plant Mol. Biol. 5: 77-84). Dans l'étude que nous présentons ici, les gènes psbA des deux algues ont été séquencés et comparés afin de déterminer la position précise de la différence de 21 kpb par rapport à celle de psbA. Comme chez les plantes supérieures, le gène de C. eugametos est continu. Par contre, …
Les sites de coupure des endonucléases de restriction AvaI, BstEII et EcoRI ainsi que les positions des gènes codant pour les ARNs ribosomiques chloroplastiques 16S et 23S et pour cinq polypeptides ont été localisés sur l'ADN chloroplastique (ADN-cp) de l'algue verte unicellulaire Chlamydomonas moewusii. La stratégie utilisée pour construire la carte physique a consisté à cloner les fragments de restriction EcoRI de l'ADN-cp dans pBR322, à cartographier chacun des fragments clonés par digestions multiples et enfin à ordonner ces fragments par hybridation aux transferts "Southern" des digestions AvaI et BstEII de l'ADN-cp. La carte ainsi construite a une grandeur de …
Les sites de coupure des endonucléases de restriction AvaI, BstEII et EcoRI ainsi que les positions des gènes codant pour les ARNs ribosomiques chloroplastiques 16S et 23S et pour cinq polypeptides ont été localisés sur l'ADN chloroplastique (ADN-cp) de l'algue verte unicellulaire Chlamydomonas moewusii. La stratégie utilisée pour construire la carte physique a consisté à cloner les fragments de restriction EcoRI de l'ADN-cp dans pBR322, à cartographier chacun des fragments clonés par digestions multiples et enfin à ordonner ces fragments par hybridation aux transferts "Southern" des digestions AvaI et BstEII de l'ADN-cp. La carte ainsi construite a une grandeur de …
Les sites de coupure des endonucléases de restriction AvaI, BstEII et EcoRI ainsi que les positions des gènes codant pour les ARNs ribosomiques chloroplastiques 16S et 23S et pour cinq polypeptides ont été localisés sur l'ADN chloroplastique (ADN-cp) de l'algue verte unicellulaire Chlamydomonas moewusii. La stratégie utilisée pour construire la carte physique a consisté à cloner les fragments de restriction EcoRI de l'ADN-cp dans pBR322, à cartographier chacun des fragments clonés par digestions multiples et enfin à ordonner ces fragments par hybridation aux transferts "Southern" des digestions AvaI et BstEII de l'ADN-cp. La carte ainsi construite a une grandeur de …