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Communication
Dbp4 est une enzyme nucléolaire qui joue un rôle essentiel dans la maturation de l’ARN ribosomique 18S. Comme toutes les ARN hélicases de la famille « DEAD-box », Dbp4 contient neuf motifs conservés formant le cœur catalytique de l’enzyme qui est flanqué par des extensions N- et C-terminales. Nous avons déjà montré que l’extension C-terminale est essentielle à la fonction de Dbp4 et que cette région contient un motif « coiled-coil » conservé chez tous les orthologues de Dbp4.Nous voulons identifier les acides aminés de l’extension C-terminale qui sont essentiels à la fonction de Dbp4. Nous utilisons un système génétique …
Communication
Des dizaines de petites ribonucléoprotéines nucléolaires (snoRNP) participent à la maturation des ARN ribosomiques (ARNr). Ces snoRNP sont constituées d’une molécule d’ARN (snoRNA) et de quelques protéines. Les snoRNA de la famille H/ACA servent de guides pour les réactions de pseudouridylation, c’est-à-dire la conversion d’uridines en pseudouridines. Contrairement aux autres snoRNP H/ACA, snR30 n’a pas de cible pour la pseudouridylation mais cette snoRNP participe aux réactions de clivage essentielles à la production de l’ARNr 18S du ribosome. Notre hypothèse est que snR30 possède des protéines spécifiques qui contribuent à ses propriétés fonctionnelles uniques. Le but de notre recherche est de …
Colloque
La caractérisation du site de liaison d'une protéine sur le RNA ribosomique peut préciser quels sont les signaux qui contrôlent la spécificité de cette interaction RNA - protéine. Nous avons examiné l'interaction de la protéine S7 avec le RNA 16S du ribosome d'E. coli. On sait que cette protéine interagit avec le domaine 3 du RNA 16S. Différents plasmides ont été construits, à partir desquels nous pouvons obtenir par transcription in vitro soit le domaine 3 complet (positions 926 à 1393), soit divers fragments de ce domaine. Nous avons ensuite examiné, par la technique de filtration sur membranes de nitrocellulose, …
Colloque
Le RNA 16S de la sous-unité 30S du ribosome bactérien est divisé en 4 domaines principaux. À partir d'un plasmide contenant le gène du RNA 16S d'E. coli sous contrôle d'un promoteur T7, nous avons construit des plasmides permettant la transcription in vitro des domaines 1 et 2, le domaine 3 et les domaines 3 et 4 du RNA 16S. Ces domaines isolés doivent globalement conserver leur structure native. Le RNA 16S peut interagir avec la sous-unité 50S in vivo. Les domaines "mini-sous-unités" 30S, isolés à partir de mutants de protéines absentes de la sous-unité 30S (S4, S6, S8, S15, …
Colloque
Le RNA 16S de la sous-unité 30S du ribosome bactérien est divisé en 4 domaines principaux. À partir d'un plasmide contenant le gène du RNA 16S d'E. coli sous contrôle d'un promoteur T7, nous avons construit des plasmides permettant la transcription in vitro des domaines 1 et 2, le domaine 3 et les domaines 3 et 4 du RNA 16S. Ces domaines isolés doivent globalement conserver leur structure native. Le RNA 16S peut interagir avec la sous-unité 50S in vivo. Les domaines "mini-sous-unités" 30S, isolés à partir de mutants de protéines absentes de la sous-unité 30S (S4, S6, S8, S15, …
Colloque
Le RNA 16S de la sous-unité ribosomique 30S d'E. coli est subdivisé en 3 principaux domaines structuraux. À partir d'un plasmide contenant le gène du RNA 16S, nous avons construit un dérivé, pFD34, qui contient une portion du gène du RNA 16S, depuis le début du domaine 3 jusqu'à l'extrémité du gène, directement en aval d'un promoteur T7. La transcription in vitro de ce plasmide linéarisé au site RsaI produit le domaine 3 du RNA 16S. Des études avec diverses sondes chimiques indiquent que ce fragment adopte une conformation semblable à celle qu'il possède à l'intérieur du RNA 16S. Lorsqu'il …
Colloque
Le RNA 16S de la sous-unité ribosomique 30S d'E. coli est subdivisé en 3 principaux domaines structuraux. À partir d'un plasmide contenant le gène du RNA 16S, nous avons construit un dérivé, pFD34, qui contient une portion du gène du RNA 16S, depuis le début du domaine 3 jusqu'à l'extrémité du gène, directement en aval d'un promoteur T7. La transcription in vitro de ce plasmide linéarisé au site RsaI produit le domaine 3 du RNA 16S. Des études avec diverses sondes chimiques indiquent que ce fragment adopte une conformation semblable à celle qu'il possède à l'intérieur du RNA 16S. Lorsqu'il …
Colloque
Le RNA 16S de la sous-unité ribosomique 30S d'E. coli est subdivisé en 3 principaux domaines structuraux. À partir d'un plasmide contenant le gène du RNA 16S, nous avons construit un dérivé, pFD34, qui contient une portion du gène du RNA 16S, depuis le début du domaine 3 jusqu'à l'extrémité du gène, directement en aval d'un promoteur T7. La transcription in vitro de ce plasmide linéarisé au site RsaI produit le domaine 3 du RNA 16S. Des études avec diverses sondes chimiques indiquent que ce fragment adopte une conformation semblable à celle qu'il possède à l'intérieur du RNA 16S. Lorsqu'il …
