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Le RNA 16S de la sous-unité 30S du ribosome bactérien est divisé en 4 domaines principaux. À partir d'un plasmide contenant le gène du RNA 16S d'E. coli sous contrôle d'un promoteur T7, nous avons construit des plasmides permettant la transcription in vitro des domaines 1 et 2, le domaine 3 et les domaines 3 et 4 du RNA 16S. Ces domaines isolés doivent globalement conserver leur structure native. Le RNA 16S peut interagir avec la sous-unité 50S in vivo. Les domaines "mini-sous-unités" 30S, isolés à partir de mutants de protéines absentes de la sous-unité 30S (S4, S6, S8, S15, …
Le RNA 16S de la sous-unité ribosomique 30S d'E. coli est subdivisé en 3 principaux domaines structuraux. À partir d'un plasmide contenant le gène du RNA 16S, nous avons construit un dérivé, pFD34, qui contient une portion du gène du RNA 16S, depuis le début du domaine 3 jusqu'à l'extrémité du gène, directement en aval d'un promoteur T7. La transcription in vitro de ce plasmide linéarisé au site RsaI produit le domaine 3 du RNA 16S. Des études avec diverses sondes chimiques indiquent que ce fragment adopte une conformation semblable à celle qu'il possède à l'intérieur du RNA 16S. Lorsqu'il …