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Transfert de BPC des sédiments aux macrophytes
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La contamination en biphényls polychlorés (BPC) des sédiments superficiels de certains sites du fleuve Saint-Laurent semble avoir diminué de façon significative ces dernières années. Par contre, les sédiments profonds du lac Saint-François peuvent présenter des contaminations aussi élevées que 15mg de BPC/kg de sédiments, poids frais. La biodisponibilité de ces BPC est peu connue, de même que l'implication des macrophytes enracinés dans cette mise en disponibilité. Par leur système racinaire, les macrophytes enrobés aux composés profondément enfouis dans les sédiments, ce qui les expose à une quantité et une diversité de congénères de BPC plus importantes que les autres producteurs …

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Étude microbiologique de la dégradation du phénol en conditions méthanogènes
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De graves problèmes de pollution sont causés par les substances phénolées. Notre projet a pour but, à partir d'un consortium méthanogène dégradant le phénol, d'isoler et de caractériser les bactéries impliquées dans la carboxylation du phénol en benzoate. Dans un premier temps, il a été démontré que les bactéries anaérobies facultatives sont responsables de cette activité. Le consortium a été traité à la chaleur (80°C/15 min), dans le but de sélectionner les bactéries sporulées et la culture résultante a conservé la capacité de carboxyler le phénol. L'observation de cette culture au microscope électronique, a montré une population bactérienne composée seulement …

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Traitement anaérobie d'un effluent pétrochimique
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À l'aide d'un consortium capable de dégrader le phénol en conditions méthanogènes, un traitement anaérobie d'un effluent pétrochimique spécifique sera élaboré. La caractérisation de l'effluent a révélé qu'il se maintient en composé de phénol, soit environ 120 mg/l, et qu'il contient entre autres, peu de soude en suspension (3 mg/l), de phosphore (0,2 mg/l) et de sulfates (3,6 mg/l). La concentration de phénol est bien enlevée à la norme du Ministère de l'Environnement du Québec. Le travail a été effectué à partir d'un réacteur en continu parce qu'il a été démontré que la congélation n'affecte pas l'effluent. Le consortium de …

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Biodégradation des BPC: Régulation de la voie de dégradation du 4-chlorobiphényle de Pseudomonas testosteroni B-356
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Le clonage de la voie de dégradation du 4-chlorobiphényle (4-CB) a mené à l'obtention de deux clones pouvant dégrader le 4-CB, DAI et DA2. À cause des faibles rendements de dégradation et afin d'en savoir plus long sur la régulation de la voie de dégradation, nous avons entrepris un second clonage, utilisant cette fois un repérage par hybridation de colonies avec une sonde d'ADN provenant du clone DAI. Les possibilités métaboliques des nouveaux clones (rendements, induction de la dégradation), mises en relation avec la carte de restriction de leurs plasmides, apportent de nouvelles informations quant à la régulation et à …

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Méthode de purification par HPLC de métabolites bactériens du 4-chlorobiphényle
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La voie de dégradation microbienne des chlorobiphényles (BPC) conduit ultimement à l'acide chlorobenzoïque correspondant. Toutefois, cette conversion génère aussi des dérivés phénoliques, acides ou nitrés des BPC dont les effets sur la santé et les effets physiologiques sont peu connus. Le clonage des gènes de dégradation du 4-chlorobiphényle de Pseudomonas testosteroni B-356 a permis d'isoler un clone, pP2 qui accumule certains de ces dérivés en quantité importante. Prenant avantage de cette situation, nous avons mis au point une méthode de séparation par HPLC en phase inverse, sur colonne C8 pour purifier l'acide 2-hydroxy-6oxo-6-phényl hexa-2,4 diénoïque et ses dérivés mono et …

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Caractérisation de la voie catabolique du 2-chlorobenzoate chez Pseudomonas sp. B300
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Pseudomonas sp. B300 est une bactérie capable de dégrader le 2-chlorobenzoate (2CBA). L'analyse des métabolites dans le milieu de culture suggère que le substrat soit d'abord transformé en catéchol ou chlorocatéchol suivi d'une fission en position "ortho" pour générer les acides muconique ou chloromuconique. Dans le but de confirmer cette voie catabolique, nous avons cloné les gènes de dégradation du 2CBA chez Pseudomonas putida KT 2440 (pCl1000). Cette souche porte les gènes de dégradation du chlorocatéchol sur le plasmide pCl100. La technique d'électrophorèse en gel de polyacrylamide a aussi été utilisée pour rechercher les bandes protéiques qui correspondraient aux enzymes …

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Métabolisme du 4-chlorobenzoate par Pseudomonas sp. CBS3 via la voie du 3-cétoadipate
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Le 4-chlorobenzoate est métabolisé par Pseudomonas sp. CBS3 via la voie du 3-cétoadipate. Ce processus implique une déshalogénation directe du noyau aromatique avant l'ouverture du cycle, une réaction enzymatique très rare. Les gènes codant cette activité ont été introduits dans un vecteur d'expression (PMM22) et transférés à Pseudomonas putida R2440 (métabolise le 4-hydroxybenzoate) d'utiliser le 4-chlorobenzoate comme seule source de carbone. Des études sur l'étendue de spécificité du système enzymatique sur substrat analogue (4-chlorophénylacétate; source de carbone utilisable par P. sp. CBS3) semblent démontrer que plus d'un gène a été cloné. Les techniques du Maxicell (avec E. coli CS 603), …

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Biodéshalogénation des BPC par des consortiums microbiens anaérobies
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Les biphényles polychlorés (BPC) sont parmi les polluants majeurs environnementaux. Ils se caractérisent par une résistance aux oxydations chimiques et biologiques et une faible solubilité dans l'eau. Cette dernière propriété favorise la concentration des BPC principalement dans les sédiments aquatiques; environnements anaérobies. La déséhalogénation réductrice des BPC n'a jamais été démontrée, mais son existence nous permettrait de convertir les BPC en des composés moins chlorés et donc potentiellement dégradables. Nous avons donc recherché dans différents écosystèmes, la présence de consortiums microbiens capables de déséhalogéner certains mono et dichlorobiphényles tels le 4-chlorobiphényle, le 2-chlorobiphényle, le 4,4'-dichlorobiphényle. Les échantillons d'environnement ont été …

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Développement d'un traitement aérobie thermophile du lisier de porc dans un réacteur à films fixes
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La production industrielle de porc au Québec a engendré d'énormes volumes de lisier qui ont généré de sérieux problèmes de pollution. Il s'avère donc nécessaire de développer un traitement efficace et peu coûteux de l'élimination du lisier de porc. Un traitement aérobie thermophile, réalisé à l'échelle de notre laboratoire, s'est révélé particulièrement intéressant. De façon à augmenter l'efficacité de ce traitement, des bactéries thermophiles ont été sélectionnées à partir de différents sols, et différents milieux de culture, sol et compost, et adaptés au lisier. Les souches formant le meilleur potentiel d'oxydation de la matière organique ont été isolées et caractérisées. …

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Clonage des gènes de Pseudomonas sp. CBS-3 spécifiant la dégradation de l'acide 4-chlorobenzoïque (4CBA)
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La dégradation bactérienne du 4-chlorophényle (4CB) nécessite deux ensembles de gènes distincts. Un premier qui convertit le 4CB en 4CBA et un second qui minéralise le 4CBA. Afin de cloner les gènes de Pseudomonas sp. CBS-3 spécifiant la dégradation du 4CBA, nous avons d'abord construit un cosmid à large spectre d'hôte, pPSB42A, vecteur dérivé des plasmides pTC9 et RSF1010. Les sites uniques de restriction sont BamHI, ClaI, HindIII, SalI et SstI. Ce vecteur est amplifiable au chloramphénicol chez E. coli et est mobilisé efficacement vers Pseudomonas sp. CBS-3. Le cosmid pPSB42A avec la banque de gènes de Pseudomonas CBS-3 a …

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