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La reconstruction de génomes ancestraux a fait des progrès importants au cours des dernières années, à la fois du point de vue de la méthodologie, de la capacité à traiter de gros jeux de données, et de la convergence avec les méthodes expérimentales. Nous nous intéressons ici à un autre aspect, à savoir la fiabilité des résultats de telles méthodes, en comparant les résultats de méthodes basées sur une parcimonie globale en termes de réarrangements de génomes et de méthodes baséee sur un principe de parcimonie locale. Nous menons notre étude en analysant deux ancêtres de levures à partir de …