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Colloque
L'étendue phylogénétique du séquençage de génomes est de plus en plus importante. Cependant, celà ne s'accompagne pas nécessairement de l'amélioration de la qualité des séquences pour l'ensemble des génomes. En effet, une proportion croissante des génomes sont publiés sous forme d'"échafaudage", ou "squelette de contigs". Un grand nombre de gènes sont absents de l'échafaudage, même si leur présence dans le génome est établie dans les ensembles d'EST. Nous proposons une méthode qui consiste à remplir de façon optimale les échafauds par les gènes manquants, tout en intégrant ces échafauds ainsi augmentés directement dans les algorithmes de réarrangement génomiques comme s'ils …
