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L’objet des modèles mécanistiques d’évolution moléculaire est de dériver le processus de substitution opérant sur la longue durée évolutive à partir des mécanismes élémentaires de la génétique des populations. De tels modèles articulent les effets combinés de la pression mutationnelle, la sélection et la dérive génétique. Ils permettent ainsi de faire une connection entre le processus de substitution et les conditions écologiques (en particulier tailles de populations), cellulaires (constitution karyotypique) physiologiques (e.g. métabolisme, temperature) ainsi que d’autres traits d’histoire de vie (longévité, temps de génération), tous susceptibles de varier, parfois sur plusieurs ordres de grandeur, entre espèces proches. Une methode …