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Au cours des 25 dernières années, la chimie théorique s’est transformée d’une discipline pratiquée presque entièrement par les théoriciens eux-mêmes à la chimie computationnelle d’aujourd’hui qui est maintenant devenue un outil important dans la recherche de plusieurs groupes expérimentaux. La modélisation devient de plus en plus utile lorsque les valeurs produites deviennent plus fiables et lorsque la taille des systèmes qui sont abordables augmente afin que nos modèles puissent devenir plus représentatifs des réactions qu’on étudie dans le laboratoire. En plus de la taille du système, la longueur des périodes de temps qu’on peut simuler nous permet de mieux reproduire …
Un algorithme qui est le plus efficace pour une petite molécule n'est pas nécessairement celui qui est le plus efficace pour une molécule de grande taille. Nous présenterons notre progrès récent avec des algorithmes où les temps de calcul croissent d'une façon linéaire (plutôt que quadratique ou cubique). Ces nouvelles méthodes sont développées à l'intérieur du logiciel DeFT qui fait des calculs basés sur la théorie de la fonctionnelle de la densité. On voit que l'étape la plus lente est maintenant associée avec la diagonalisation de la matrice Kohn-Sham. Les alternatives possibles seront considérées. Également, nous discuterons la parallélisation de …
Un algorithme qui est le plus efficace pour une petite molécule n'est pas nécessairement celui qui est le plus efficace pour une molécule de grande taille. Nous présenterons notre progrès récent avec des algorithmes où les temps de calcul croissent d'une façon linéaire (plutôt que quadratique ou cubique). Egalement, nous discuterons la parallélisation de ces algorithmes sur des superordinateurs massivement parallèles.
Depuis les 15 dernières années, des développements rapides se sont produits dans le domaine des optimisations de géométries de molécules dans les méthodes quantiques ab initio. Ces progrès sont principalement dus aux techniques du gradient de l'énergie pour la caractérisation des surfaces d'énergie potentielle. Récemment, l'introduction du calcul du gradient analytique a été faite dans une méthode de la fonctionnelle de la densité soit LCGTO-LSD. Ce gradient est utilisé pour la recherche de minimas, points de selle et pour suivre les coordonnées internes des réactions. Plusieurs algorithmes existent à cet effet. Ils seront présentés et leurs efficacités discutées d'abord en …
Dans la méthode MO-LCGTO, l'énergie d'une molécule est une fonction de la géométrie des noyaux et des coefficients choisis pour construire les orbitales moléculaires. Dans la méthode "dynamique de Car et Parrinello" (méthode de simulation), on introduit un Lagrangien abstrait qui donne des équations de mouvement pour les noyaux et les coefficients. En laissant le système évoluer dans le "temps" et en relaxant, peu à peu les équations de mouvement des électrons jusqu'à ce que ces derniers soient statiques, on optimise simultanément la géométrie moléculaire et les coefficients SCF. Nous développerons une méthode qui facilitera l'optimisation de la géométrie pour …