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Les souches du genre Frankia sont des actinomycètes capables de convertir l'azote gazeux en ammonium grâce au complexe de la nitrogénase. Au champ, nous les retrouvons en symbiose avec des plantes dicotylédones pionnières des genres Alnus, Casuarina, Hippophae, etc. Cette association a donné lieu à plusieurs applications comme la stabilisation des dunes et l'enrichissement de sols endommagés et pauvres en complexes azotés. Ce travail a consisté en l'identification de zones de variations au niveau d'un segment de plus de 280 pb du 16S l'ADN chez plus d'une trentaine de souches de Frankia en utilisant la réaction en chaîne de la …
La séquence nucléotidique complète du gène nifH des souches de Frankia ArI3 et HRN1a a été déterminée. Ces séquences ont pu être comparées aux gènes nifH de plusieurs microorganismes déjà publiés. Des analyses de regroupement ont été effectuées à partir des similarités entre paires de séquences (acides aminés et nucléiques). Les arbres phylogénétiques obtenus comparables en général à ceux basés sur les 16S rRNA. Cependant, Frankia se retrouve proche de la cyanobactérie Anabaena et éloignée de Clostridium, une autre bactérie Gram+. De plus, la séquence nif (type 3) d'Azotobacter est divergente de l'autre nifH conventionnelle (type 1) présente dans la …
Le plasmide pF031 de 8.3 Kb, indigène à la souche de Frankia ArI3 a été cloné dans le vecteur pKT230 d'E. coli. Le plasmide recombinant, pFQ100, ne possède pas d'homologie détectable avec un autre plasmide présent dans la même souche, pFQ32, de 18 Kb. Une carte de restriction a pu être établie, en utilisant 5 enzymes de restriction. En vue d'une utilisation de ce plasmide comme vecteur pour cloner chez Frankia, les gènes impliqués dans la symbiose, d'autres gènes de résistance à différents antibiotiques ont été rajoutés au plasmide pFQ100.