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Plusieurs méthodes existent pour déduire la structure secondaire d'une protéine à partir de la structure primaire - sa séquence d'acides aminés. Ces méthodes, toutes approximatives, produisent généralement des résultats qui sont sensiblement différents. Nous pouvons réconcilier ces résultats formellement sans perdre de l'information en utilisant une représentation par réseau dirigé. En comparant des réseaux ainsi obtenus de séquences d'acides aminés de protéines homologues chez différentes espèces, nous pouvons ensuite essayer d'extraire l'unique structure secondaire qu'elles ont en commun. Nous faisons ceci en nous servant d'un algorithme de programmation dynamique de Kruskal et Sankoff pour la comparaison de réseaux en l'appliquant …
Plusieurs méthodes existent pour déduire la structure secondaire d'une protéine à partir de la structure primaire - sa séquence d'acides aminés. Ces méthodes, toutes approximatives, produisent généralement des résultats qui sont sensiblement différents. Nous pouvons réconcilier ces résultats formellement sans perdre de l'information en utilisant une représentation par réseau dirigé. En comparant des réseaux ainsi obtenus de séquences d'acides aminés de protéines homologues chez différentes espèces, nous pouvons ensuite essayer d'extraire l'unique structure secondaire qu'elles ont en commun. Nous faisons ceci en nous servant d'un algorithme de programmation dynamique de Kruskal et Sankoff pour la comparaison de réseaux en l'appliquant …
Plusieurs méthodes existent pour déduire la structure secondaire d'une protéine à partir de la structure primaire - sa séquence d'acides aminés. Ces méthodes, toutes approximatives, produisent généralement des résultats qui sont sensiblement différents. Nous pouvons réconcilier ces résultats formellement sans perdre de l'information en utilisant une représentation par réseau dirigé. En comparant des réseaux ainsi obtenus de séquences d'acides aminés de protéines homologues chez différentes espèces, nous pouvons ensuite essayer d'extraire l'unique structure secondaire qu'elles ont en commun. Nous faisons ceci en nous servant d'un algorithme de programmation dynamique de Kruskal et Sankoff pour la comparaison de réseaux en l'appliquant …
En français standard, le quantificateur a les mêmes propriétés morphologiques que le SN auquel il est lié: (1) Mes amis sont tous /tUs/ venus (2) Je les ai tous /tUs/ vus (3) Mes soeurs sont toutes /tUt/ à l'université. En français de Montréal, la forme /tUt/ est toujours possible. Il est également possible de lier un quantificateur au SN à sa droite: (4) J'ai /tUt/ vu les films. Ces deux caractéristiques, neutralisation de la forme du quantificateur et absence de contrainte sur sa portée, sont la source de nombreuses ambiguïtés: (5) Mes amis ont /tUt/ vu les films de Marx. …
Suivant un critère de convergence, les tRNA de la phénylalanine et de la méthionine (initiateurs) constituent chacun une famille de séquences homologues; les tRNA mitochondriaux, cependant, semblent provenir d'une lignée extrêmement ancienne. Les deux arbres phylogénétiques obtenus concordent avec l'historique évolutif des procaryotes et des eucaryotes. La construction de séquences ancestrales et la localisation des points chauds de mutation montrent que le processus évolutif a conservé strictement les bases responsables des interactions en structure tertiaire; les régions du boucle D sont beaucoup plus variables, en tenant que le pairage n'est pas affecté.
Les RNA 5S et 5.8S ribosomiques se retrouvent dans la grosse sous-unité des ribosomes eucaryotes. La présence du RNA 5.8S est particulière aux eucaryotes et cartographiquement étroitement liée entre un RNA 5S procaryote ou course une position analogue au gène du RNA 5.8S eucaryote sur l'opéron polycistronique du RNA ribosomique dans ces deux types d'organismes. Par comparaison de séquences, nous avons démontré que le RNA 5.8S a une homologie analogue qui traduit par une homologie évolutive des deux espèces. Nous avons démontré que les séquences du RNA 5.8S de levure et les séquences de l'histone d'histone homologuent de l'existence d'une …
Le débat en sociolinguistique concernant la compétence linguistique des personnes provenant des milieux "défavorisés", s'avère difficile à résoudre dû au manque de critères pour évaluer le langage des adultes. Nous examinons un tel critère, le nombre de mots différents utilisé pendant une conversation d'une durée donnée. Une analyse statistique de régression de ce critère chez 120 sujets parlants nous montre que deux facteurs socio-démographiques qui l'influencent. D'abord, cette mesure de diversité linguistique tend à augmenter avec l'âge (entre 15 et 60 ans). Deuxièmement, le taux de cette augmentation est fortement affecté par le niveau de scolarité atteint par l'individu. Les …
La tendance d'harmonisation la plus commune en français est la fermeture d'une voyelle mi-ouverte suivie d'une voyelle fermée, ainsi que l'ouverture d'une voyelle mi-fermée suivie d'une voyelle ouverte. Dumas, en considérant le relâchement des voyelles fermées dans le français de Montréal, postule une règle d'harmonisation pour ces voyelles. Lors d'une étude spectrographique, nous avons trouvé une harmonisation plus générale qui déplace, pour la plupart, une voyelle non-accentuée vers la voyelle qui la suit. On étudie cet effet par rapport à l'antériorité de la voyelle plutôt que par rapport à son hauteur. Pour ce faire, nous analysons la variation du deuxième …
En se basant sur une comparaison, deux par deux, des trente-six séquences connues des acides ribonucléiques de transfert (tRNA), Jukes et Holmquist ont proposé qu'au cours de l'évolution des espèces, les tRNA avaient continuellement leur spécificité vis-à-vis des acides aminés. Ceci est indiqué par le fait que deux tRNA du même organisme, mais spécifiques pour les acides aminés différents, ont un niveau de similarité supérieur à celui attendu. En nous basant sur une analyse de congruence des séquences de tRNA par le moyen des distances multidimensionnelles (multidimensional scaling) nous déduisons contrairement à ces auteurs que les tRNA ont vraiment changé …
En se basant sur une comparaison, deux par deux, des trente-six séquences connues des acides ribonucléiques de transfert (tRNA), Jukes et Holmquist ont proposé qu'au cours de l'évolution des espèces, les tRNA avaient continuellement leur spécificité vis-à-vis des acides aminés. Ceci est indiqué par le fait que deux tRNA du même organisme, mais spécifiques pour les acides aminés différents, ont un niveau de similarité supérieur à celui attendu. En nous basant sur une analyse de congruence des séquences de tRNA par le moyen des distances multidimensionnelles (multidimensional scaling) nous déduisons contrairement à ces auteurs que les tRNA ont vraiment changé …