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À l’ère de la phylogénomique, caractériser les propriétés évolutives des données, afin de diminuer les erreurs systématiques, est primordial pour obtenir une phylogénie correcte. La possibilité que les données soient soumises à l’hétérotachie fait aujourd’hui consensus, mais cette caractéristique se focalise sur l’aspect quantitatif du processus évolutif, ignorant le côté qualitatif. C’est pourquoi nous avons étudié la variation au cours du temps du processus substitutionnel en acides aminés, et regardé son impact sur l’inférence phylogénétique. Nous avons utilisé les profils substitutionnels définis par le modèle CAT comme approximation pour caractériser les variations de profils entre différents clades monophylétiques. À partir …